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UMR Procédés Alimentaires et Microbiologiques

Laboratoire de culture et de conservation de microorganismes strictement anaérobies

 Responsable : Pr Laurent BENEY

Intérêt de la culture en anaérobie

 

Le microbiote intestinal est constitué de 100 mille-milliards de cellules bactériennes, c’est à dire 10 fois plus que de cellules humaines(1). La plus grande partie de ces bactéries se concentre dans le colon, qui offre des conditions environnementales d’anaérobie totale. Ainsi, la majeure partie des bactéries constituant notre microbiote sont anaérobies strictes(2). Ces dernières requièrent des conditions environnementales nutritives et gazeuses complexes nécessaires à leurs croissances.

 

De nombreuses études montrent l’intérêt de mieux connaitre ces bactéries anaérobies et leur impact sur la santé de l’hôte. En effet, la faible abondance de ces bactéries dans le microbiote intestinal a déjà pu être corrélée avec le développement de maladies intestinales chroniques de l'intestin(3,4,5). Ainsi, le développement d’outils biotechnologiques pour la culture, la stabilisation et la conservation de ces bactéries plus sensibles que celles produites aujourd’hui sont des challenges qui ont été relevés au sein de l’UMR-PAM dans le cadre de plusieurs projets collaboratifs entre partenaires académiques et industriels.

 

L’intérêt de la culture en anaérobie ne s’arrête pas au microbiote humain, cette problématique est aussi souvent rencontrée lors de la production de biocarburant à l’aide de bactéries ou lors de l’étude de niches écologiques caractérisées par l’absence d’oxygène telles que les fonds marins.

 

Un laboratoire dédié à l’anaérobie à la pointe de la biotechnologie

 

L’UMR-PAM est dotée de moyens humains et matériels qui permettent l’étude de microorganismes extrêmement sensibles à l’oxygène (EOS) et donc difficiles à cultiver et à conserver. Au-delà de l’étude de ces microorganismes complexes, les impacts de la modification de l’atmosphère gazeuse sur les propriétés de microorganismes et sur leurs réactions aux stress sont des problématiques qui sont abordées au sein de l’UMR-PAM(6).

 

Des résultats prometteurs, dans le cadre d’un projet FUI sur la production d’une bactérie strictement anaérobie et EOS, ont déjà été obtenus concernant la production de biomasse à grande échelle, l’optimisation du rendement de stabilisation et sa viabilité après de longues durées de conservation.

 

Communication orale lors du Colloque Flores microbiennes d'intérêt du 7 octobre 2014 : Le cas problématique des bactéries strictement anaérobies


 

 

 

 

 

 

Références :

  • (1) Hooper, L. V., & Gordon, J. I. (2001). Commensal host-bacterial relationships in the gut. Science, 292(5519), 1115-1118.
  • (2) Hold, G. L., Schwiertz, A., Aminov, R. I., Blaut, M., & Flint, H. J. (2003). Oligonucleotide probes that detect quantitatively significant groups of butyrate-producing bacteria in human feces. Applied and environmental microbiology, 69(7), 4320-4324.
  • (3) Sokol, H., Pigneur, B., Watterlot, L., Lakhdari, O., Bermúdez-Humarán, L. G., Gratadoux, J. J., ... & Langella, P. (2008). Faecalibacterium prausnitzii is an anti-inflammatory commensal bacterium identified by gut microbiota analysis of Crohn disease patients. Proceedings of the National Academy of Sciences, 105(43), 16731-16736.
  • (4) Qin, J., Li, R., Raes, J., Arumugam, M., Burgdorf, K. S., Manichanh, C., ... & Weissenbach, J. (2010). A human gut microbial gene catalogue established by metagenomic sequencing. Nature, 464(7285), 59-65.
  • (5) Ebel, B., Lemetais, G., Beney, L., Cachon, R., Sokol, H., Langella, P., & Gervais, P. (2014). Impact of probiotics on risk factors for cardiovascular diseases. A review. Critical reviews in food science and nutrition, 54(2), 175-189.
  • (6) Ebel, B., Martin, F., Le, L. D. T., Gervais, P., & Cachon, R. (2011). Use of gases to improve survival of Bifidobacterium bifidum by modifying redox potential in fermented milk. Journal of dairy science, 94(5), 2185-2191.
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04 juil 2017 - Ali ASSIFOUI
29 juin 2017 - Alexis DE ROUGEMONT
17 fev  2017 - Hélène SIMONIN
05 juin 2015 - Thomas Karbowiak

 

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09 juin 2017 - Yousseef Manhal
13 mars 2017 - Jeancarlo Renzo Rocca Smith
15 fev 2017 - Hoang Bao Ngoc PHAM


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13 dec 2016 - Fiona ZOZ
08 dec 2016 - Céline LAFARGE
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17 oct 2016 - Dat N'Guyen
12 oct 2016 - HUYNH Thi Diem Uyen
12 juil 2016 - Mohamed Lazhar CHIHI
06 juin 2016 - Ewelina BASIAK
29 avr 2016 - Simone SCUSSAT
08 avr 2016 - Delphine LAROSE
02 fev 2016 - Cyril IACONELLI
25 jan 2016 - Cédric GRANGETEAU

 

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